Òáèëèññêèé ãîðîäñêîé ñóä 5 èþëÿ áûâøåìó ìèíèñòðó îáîðîíû è âíóòðåííèõ äåë Áà÷î Àõàëàèÿ èçáðàë â êà÷åñòâå ìåðû îáâèíåíèÿ ïðåäâàðèòåëüíîå çàêëþ÷åíèå â ñâÿçè ñ íîâûìè îáâèíåíèÿìè, êîòîðûå áûëè âûäâèíóòû ïðîòèâ íåãî 2 èþëÿ.
Ñîãëàñíî íîâûì îáâèíåíèÿì, âî âðåìÿ ðàáîòû íà ïîñòó ìèíèñòðà îáîðîíû â ñåíòÿáðå 2011 ãîäà Àõàëàèÿ, êàê çàÿâèëà Ïðîêóðàòóðà, «îðãàíèçîâàë ïûòêè» íåñêîëüêèõ ëèö, à òàêæå «îðãàíèçîâàë ñåêñóàëüíîå íàñèëèå» â îòíîøåíèè çàäåðæàííîãî ñ òðåáîâàíèåì ïðèçíàíèÿ ñ åãî ñòîðîíû øïèîíàæà â ïîëüçó Ðîññèè.
Ñòîðîíà çàùèòû Àõàëàèÿ, êîòîðàÿ íàçûâàåò ýòè îáâèíåíèÿ àáñóðäíûìè, è âìåñòî ïðåäâàðèòåëüíîãî çàêëþ÷åíèÿ ïðîñèëà èçáðàòü äëÿ íåãî âûïëàòó çàëîãà â ðàçìåðå 30 òûñÿ÷ ëàðè, çàÿâëÿåò, ÷òî ðåøåíèå ñóäà, «ñ áîëüøîé âåðîÿòíîñòüþ», îáæàëóåò â àïåëëÿöèîííîì ñóäå. Ñòîðîíà çàùèòû òàêæå çàÿâëÿåò, ÷òî âûäâèæåíèå íîâûõ îáâèíåíèé ñëóæèò öåëè îñòàâèòü Áà÷î Àõàëàèÿ â çàêëþ÷åíèè, òàê êàê ìàêñèìàëüíûé äåâÿòèìåñÿ÷íûé ñðîê èçáðàííîãî åìó ïðåäâàðèòåëüíîãî çàêëþ÷åíèÿ ïî äðóãîìó äåëó èñòåêàåò 26 èþëÿ.
 îòíîøåíèè Àõàëàèÿ, êîòîðûé íàõîäèòñÿ â ïðåäâàðèòåëüíîì çàêëþ÷åíèè ñ íîÿáðÿ 2012 ãîäà, ïðîøëè ñóäåáíûå ïðîöåññû ïî íåñêîëüêèì äåëàì, à åùå ïî íåñêîëüêèì äðóãèì äåëàì ïðîöåññû ïðîäîëæàþòñÿ.
Åãî îïðàâäàëè ïî ÷åòûðåì îòäåëüíûì äåëàì î ïðåâûøåíèè ñëóæåáíûõ ïîëíîìî÷èé, íåçàêîííîãî ëèøåíèÿ ñâîáîäû è ïûòêàìè.
 êîíöå îêòÿáðÿ ïðîøëîãî ãîäà Áà÷î Àõàëàèÿ áûë ïðèçíàí âèíîâíûì ïî äåëó î íåãóìàííîì îòíîøåíèè ê çàêëþ÷åííûì âî âðåìÿ ðàáîòû íà ïîñòó ïðåäñåäàòåëÿ Äåïàðòàìåíòà ïî èñïîëíåíèþ íàêàçàíèÿ è åìó ïðèñóäèëè çàêëþ÷åíèå íà 3 ãîäà è äåâÿòü ìåñÿöåâ, íî òîãäàøíèé ïðåçèäåíò Ìèõàèë Ñààêàøâèëè ïîìèëîâàë åãî â íà÷àëå íîÿáðÿ 2013 ãîäà.
Íåñìîòðÿ íà ïîìèëîâàíèå ñî ñòîðîíû ïðåçèäåíòà, Àõàëàèÿ îñòàâàëñÿ â ïðåäâàðèòåëüíîì çàêëþ÷åíèè ïî îáâèíåíèþ â ïðåâûøåíèè ñëóæåáíûõ ïîëíîìî÷èé, êîòîðûå áûëè âûäâèíóòû ïðîòèâ íåãî ïî äåëó Ñàíäðî Ãèðãâëèàíè, ñâÿçàííîãî ñ ïåðèîäîì åãî ðàáîòû íà ïîñòó ðóêîâîäèòåëÿ ñèñòåìû èñïîëíåíèÿ íàêàçàíèÿ; Ñóäåáíûé ïðîöåññ ïî äàííîìó äåëó åùå ïðîäîëæàåòñÿ.
Ñóäåáíûé ïðîöåññ òàêæå âåäåòñÿ ïî îòäåëüíîìó äåëó, êîòîðîå êàñàåòñÿ îáâèíåíèé â ïûòêàõ, è ïî êîòîðûì ïðîêóðàòóðà îáâèíÿåò àõàëàèÿ â èçáèåíèè øåñòè çàêëþ÷åííûõ â 2006 ãîäó, â ïåðèîä ðàáîòû ðóêîâîäèòåëåì ñèñòåìû èñïîëíåíèÿ íàêàçàíèÿ.